| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 70 (1.310) | 32/98 | NT | 100% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 576911 = | 0 (0.000) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme | |||||
CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/315638‑315707‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTAT > W3110S.gb/576911‑576980 CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:110226/71‑1 CTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAAC > 1:269827/1‑71 CCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:3474653/64‑1 CGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:2858739/1‑63 AACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGT > 1:4339819/1‑71 AACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGT > 1:23768/1‑71 ACAATTTGAAACCAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGAGGGTAGGATCAACTGGCCCAAG > 1:317804/1‑69 CAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:1413762/1‑58 AATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGG > 1:4582733/1‑70 TTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAAC < 1:3325857/56‑1 TGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:3094395/70‑1 TGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:3100420/70‑1 AAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:2429183/70‑1 AAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:3210528/70‑1 AGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG < 1:2971695/71‑1 ACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGG > 1:1996536/1‑69 ACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGG > 1:2251628/1‑69 CCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:4112704/41‑1 TTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGT > 1:447562/1‑69 TTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGT > 1:4024996/1‑69 TTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGT > 1:696700/1‑69 TTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGG < 1:50739/62‑1 TTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:4446810/52‑1 TTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:1310791/52‑1 TTAGGACTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGT > 1:3926769/1‑69 TAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAt > 1:4868167/1‑70 AGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACG < 1:612760/51‑1 GGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCT < 1:3538408/71‑1 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:2282810/71‑1 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGAT > 1:2348737/1‑51 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGAT > 1:869599/1‑51 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGAT > 1:4890598/1‑51 CCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA > 1:3574109/1‑70 CTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA > 1:4429192/1‑71 TGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:4225048/1‑55 TGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:1950201/1‑55 GTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGTAAGGTGTCAGCTACATAC > 1:715561/1‑70 GTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATAC > 1:1535771/1‑70 GTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATA > 1:1001858/1‑69 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:3698212/41‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:2565618/41‑1 CCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCT < 1:3480074/62‑1 CCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGT < 1:2056626/37‑1 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTt < 1:2320350/60‑2 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:4814854/60‑1 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGCTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:2780182/60‑1 TTACGTGGGTAGTATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAA < 1:2035827/71‑1 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAA < 1:1402038/71‑1 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAA < 1:1396131/71‑1 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:2896767/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACAT > 1:2775239/1‑61 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACAT > 1:3839225/1‑61 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAC > 1:3128868/1‑59 ACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:2141110/1‑67 ACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATAC > 1:2937463/1‑66 ACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA > 1:1708977/1‑35 CGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGA < 1:4505762/70‑1 TGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTG < 1:858331/46‑1 GGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATT > 1:4241394/1‑71 GGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTTAGCTACATACCATACAAAGATATTG > 1:1107871/1‑71 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGAT > 1:4542519/1‑66 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGAT > 1:4895332/1‑66 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGA > 1:3183321/1‑65 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA < 1:460590/61‑1 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA < 1:1920529/61‑1 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAG < 1:937323/47‑1 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAG < 1:1297023/47‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTT < 1:4284436/71‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTT < 1:3644068/71‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTT > 1:4633856/1‑71 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGT > 1:4886927/1‑70 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG < 1:332673/35‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG < 1:2573803/35‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG < 1:308369/35‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG < 1:3511797/35‑1 AGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGAT > 1:1799784/1‑64 AGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGAT > 1:2849467/1‑64 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGT < 1:2406012/71‑1 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTG < 1:4997982/69‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA > 1:2109674/1‑47 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:4606597/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:179960/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:435456/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:3603289/70‑1 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > 1:2006079/1‑71 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:2539331/1‑50 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:702123/1‑50 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:1515424/1‑50 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTAT > 1:2894214/1‑71 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:2577274/68‑1 CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/315638‑315707‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTAT > W3110S.gb/576911‑576980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |