| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 811,947 | G→T | 23.3% | G382V (GGC→GTC) A2S (GCA→TCA) |
bioF → bioC → |
8‑amino‑7‑oxononanoate synthase predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 811,947 | 0 | G | T | 23.3% | 163.9 / 24.2 | 60 | G382V (GGC→GTC) A2S (GCA→TCA) | bioF bioC | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (21/25); new base T (4/10); total (25/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
GACTGCGCTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATG > W3110S.gb/811878‑812013 | gACTGCGCTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATgg > 1:2520823/1‑70 (MQ=255)gACTGCGCTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGc < 1:3664353/71‑1 (MQ=255) gcgcTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGATGAATGGCAACg > 1:1614002/1‑71 (MQ=255) cgcTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACgg > 1:19956/1‑71 (MQ=255) cgcTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACgg > 1:3945641/1‑71 (MQ=255) cTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGt > 1:4199842/1‑70 (MQ=255) cTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGt > 1:3512302/1‑70 (MQ=255) aaCGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTtaa > 1:2474120/1‑70 (MQ=255) aCGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTtaata < 1:2939528/71‑1 (MQ=255) aCGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTtaat < 1:1853794/70‑1 (MQ=255) gCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATaaa < 1:3068751/71‑1 (MQ=255) gCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATaaa < 1:4532462/71‑1 (MQ=255) aaCCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCaa > 1:967097/1‑57 (MQ=255) aaCCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCaa > 1:4738048/1‑57 (MQ=255) aCCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCaa > 1:1911088/1‑56 (MQ=255) aCCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACa < 1:3457867/69‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGc < 1:2547142/71‑1 (MQ=255) cGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGc > 1:2027567/1‑70 (MQ=255) cgcATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAGTAAACAAGCCATTg < 1:3587196/70‑1 (MQ=255) cgcATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTg < 1:4366305/70‑1 (MQ=255) aaaTGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATaaa > 1:4776199/1‑54 (MQ=255) aTGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCAt < 1:2301235/71‑1 (MQ=255) aTGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCAt < 1:1526200/71‑1 (MQ=255) aTGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCAt < 1:4039421/71‑1 (MQ=255) cAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTg > 1:1029522/1‑59 (MQ=255) cAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg > 1:4229150/1‑71 (MQ=255) cAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg > 1:4534334/1‑71 (MQ=255) aGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTgg < 1:667598/71‑1 (MQ=255) ggATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGcc < 1:4746170/53‑1 (MQ=255) gATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTtaataa < 1:3709286/45‑1 (MQ=255) gATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg < 1:293124/68‑1 (MQ=255) atatCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTtaataa < 1:1855611/44‑1 (MQ=255) atatCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCAt < 1:1206193/53‑1 (MQ=255) tatCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg < 1:1370903/66‑1 (MQ=255) atCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCggg > 1:4548264/1‑71 (MQ=255) tCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGc < 1:1615037/71‑1 (MQ=255) gACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAAc > 1:1273236/1‑41 (MQ=255) gACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCg > 1:1107461/1‑55 (MQ=255) gACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAg > 1:1368789/1‑71 (MQ=255) cGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCg < 1:5017398/71‑1 (MQ=255) cGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCg < 1:2456786/71‑1 (MQ=255) cGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCg < 1:2846066/71‑1 (MQ=255) tCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGcc < 1:5019753/41‑1 (MQ=255) tCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCg < 1:3102682/61‑1 (MQ=255) tCTGCTGGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCg < 1:4412860/61‑1 (MQ=255) tgctgGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGcaca > 1:1986738/1‑71 (MQ=255) tgctgGAGGTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGcaca > 1:1535427/1‑71 (MQ=255) tgGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTa > 1:2996330/1‑71 (MQ=255) ggAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCAt > 1:3956921/1‑37 (MQ=255) gAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCa < 1:1611792/35‑1 (MQ=255) gAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTg > 1:4071199/1‑38 (MQ=255) gTGCTGCATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg < 1:3202133/47‑1 (MQ=255) gTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAg > 1:355294/1‑70 (MQ=255) tgctgcATGTCAACGGTTAATAACCAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCa < 1:2774922/71‑1 (MQ=255) tgctgcATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCa < 1:3572144/71‑1 (MQ=255) tgctgcATGTCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCa < 1:1687792/71‑1 (MQ=255) ctgcATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCaa < 1:569095/70‑1 (MQ=255) cATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACAt < 1:2623209/70‑1 (MQ=255) aTGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATg > 1:854289/1‑70 (MQ=255) tGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg < 1:3625577/39‑1 (MQ=255) tGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTg < 1:1875549/39‑1 (MQ=255) ggCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGTGGCAt < 1:1355623/35‑1 (MQ=255) gCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAg > 1:780468/1‑46 (MQ=255) gCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATg > 1:4747430/1‑67 (MQ=255) | GACTGCGCTTAACGCTAACCGCTGCGCATGAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATG > W3110S.gb/811878‑812013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |