Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	243529	244884	1356	64 [0]	[0] 15	lpcA–[yafJ]	lpcA,[yafJ]

GCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGC  >  W3110S.gb/243468‑243528                                                             | gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGGGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTAAATTTATGc  <  1:68613/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:53711/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:67633/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:66617/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:64240/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:64032/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:57112/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:54984/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:54414/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:44313/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:52692/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:52625/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:48422/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:46764/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:46251/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:45088/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:43356/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:68998/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:69419/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:69526/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:69672/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:6978/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:740/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:74596/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:78675/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:80492/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:83166/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:83231/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:84370/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:86955/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:87793/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:9221/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:27808/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:13337/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:13920/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:15374/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:15859/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:16100/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:18024/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:22180/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:24290/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:24348/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:24507/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:25102/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:2531/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:25943/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:26984/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:12275/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:28052/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:28747/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:29085/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:29926/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:30949/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:31090/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:33246/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:36607/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:37596/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:38095/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:39965/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:40003/61‑1 (MQ=255) gCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:42061/61‑1 (MQ=255)  cccGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:35678/60‑1 (MQ=255)  cccGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:39703/60‑1 (MQ=255)                           tCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGc  <  1:18547/35‑1 (MQ=255)                                                             | GCCCGTACTTCTCGCTTTTGGCGGTATCCGGTACACTGCATTTTGTCTATTACATTTATGC  >  W3110S.gb/243468‑243528

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑