Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	331150	331198	49	59 [0]	[0] 69	betT/yahA	choline transporter of high affinity/predicted DNA‑binding transcriptional regulator

TATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAA  >  W3110S.gb/331088‑331149                                                              | tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAATGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:51910/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:7343/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:58144/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:612/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:61335/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:61512/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:61892/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:62084/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:62696/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:65168/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:66809/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:67295/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:70262/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:71567/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:7210/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:5663/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:73844/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:74337/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:74420/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:74939/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:75109/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:75293/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:77679/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:80599/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:81084/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:84528/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:86613/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:88426/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:8967/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:9720/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:36429/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:12882/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:14302/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:18818/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:19947/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:26650/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:27119/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:29322/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:29781/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:30162/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:30463/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:34225/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:35637/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:36357/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:11426/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:3708/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:40827/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:44238/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:45315/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:46864/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:49154/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:49808/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:50635/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:53103/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:53986/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:54407/62‑1 (MQ=255) tATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:55097/62‑1 (MQ=255)   tCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:69134/60‑1 (MQ=255)              aTGGATTCAGTCTTAATGAGAGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa  <  1:35263/49‑1 (MQ=255)                                                              | TATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAA  >  W3110S.gb/331088‑331149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑