Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	598524	599051	528	30 [0]	[0] 17	cusA	copper/silver efflux system, membrane component

GAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCT  >  W3110S.gb/598462‑598523                                                              | gAAGTGGCGTCGGTGTGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:35914/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCATGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:46335/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:46922/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:8999/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:82498/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:82112/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:77116/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:72753/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:72107/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:72033/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:65001/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:62258/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:49879/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:49858/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:49044/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:47544/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:16409/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:45626/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:45032/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:4492/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:42749/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:38789/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:31383/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:29551/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:29098/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:28752/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:24091/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:23725/62‑1 (MQ=255)  aaGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:38948/61‑1 (MQ=255)                     tgtgGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCt  <  1:59706/42‑1 (MQ=255)                                                              | GAAGTGGCGTCGGTGGGCGGTGTGGTGAAAGAGTATCAGGTGGTTATCGATCCCCAGCGCCT  >  W3110S.gb/598462‑598523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑