Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1127741	1129979	2239	87 [0]	[0] 23	[yceH]–[mviN]	[yceH],mviM,[mviN]

GTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAAT  >  W3110S.gb/1127679‑1127740                                                              | gtgcTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:47130/59‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAATGAGAATCTCATGAAat  <  1:20451/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:74057/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:75095/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:73361/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:7267/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:72101/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:68306/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:66965/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:65719/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:64874/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:63785/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:62462/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:61066/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:61002/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:59837/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:59257/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:59071/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:57810/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:57541/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:56226/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:55895/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:85797/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:9503/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:9266/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:88554/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:88236/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:88007/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:87945/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:87421/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:86618/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:86534/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:85905/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:74658/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:85115/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:83731/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:8344/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:82975/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:82150/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:8197/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:79822/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:76809/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:53868/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:26744/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:33583/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:32821/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:32809/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:31411/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:31381/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:30408/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:29922/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:2758/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:27542/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:26761/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:52650/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:25957/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:23859/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:21731/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:20597/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:1454/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:12910/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:12892/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:12664/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:11739/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:37511/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:1080/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:51722/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:51717/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:4992/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:49773/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:49523/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:49284/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:47596/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:46604/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:45831/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:4511/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:44306/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:43297/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:41280/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:38702/62‑1 (MQ=255) gTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:36321/62‑1 (MQ=255) gTACTCACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:59962/62‑1 (MQ=255) gTACTCACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:79339/62‑1 (MQ=255)  tACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:25091/61‑1 (MQ=255)  tACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:50985/61‑1 (MQ=255)  tACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:11691/61‑1 (MQ=255)      gACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAat  <  1:5873/57‑1 (MQ=255)                                                              | GTACTGACGGCATTAACTACCCCAGACTGGACGCCCGGCCGCTAAGGAGAATCTCATGAAAT  >  W3110S.gb/1127679‑1127740

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑