Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1131963	1140044	8082	14 [0]	[0] 42	[flgA]–[flgK]	[flgA],flgB,flgC,flgD,flgE,flgF,flgG,flgH,flgI,flgJ,[flgK]

TTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCC  >  W3110S.gb/1131902‑1131962                                                             | ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:23251/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:24107/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:30419/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:31364/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:34124/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:35834/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:40117/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:45383/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:5975/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:6638/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:71007/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:71809/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:86799/61‑1 (MQ=255) ttGGCGCTAAACCCATCACCGCCGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGcc  <  1:86828/61‑1 (MQ=255)                                                             | TTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCC  >  W3110S.gb/1131902‑1131962

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑