Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1221818	1222189	372	85 [0]	[0] 37	ymgF/ycgH	hypothetical protein/ECK1157:JW5901:b1169; hypothetical protein, N‑ter fragment

GAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAG  >  W3110S.gb/1221757‑1221817                                                             | gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:63967/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:69630/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:68487/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:68279/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:67869/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:6758/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:66162/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:66116/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:65175/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:63975/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:70090/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:63643/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:63394/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:61130/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:59850/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:57767/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:56225/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:1331/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:54672/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:54541/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:79416/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:8818/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:88150/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:87172/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:86095/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:83008/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:81770/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:81600/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:81335/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:80653/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:5469/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:79168/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:76800/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:75678/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:75071/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:74936/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:74166/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:73304/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:70906/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:70594/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:26242/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:52718/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:30118/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:29796/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:29323/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:2929/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:29023/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:290/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:28697/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:28086/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:30164/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:2522/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:23885/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:20642/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:17970/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:16684/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:16599/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:15654/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:15601/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:14139/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:44442/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:52652/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:52630/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:51670/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:50987/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:48476/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:47477/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:45387/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:44879/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:33637/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:43509/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:42404/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:40968/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:39620/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:39155/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:37058/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:36150/61‑1 (MQ=255) gagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:35248/61‑1 (MQ=255)  agTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:77753/60‑1 (MQ=255)  agTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:59226/60‑1 (MQ=255)  agTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:83939/60‑1 (MQ=255)   gTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:85170/59‑1 (MQ=255)        gAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:70341/54‑1 (MQ=255)                   gATGCTGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:34765/43‑1 (MQ=255)                        tGTAGATGATGAAGTTTGTGATTCTAACAGTTACGAAg  <  1:82091/38‑1 (MQ=255)                                                             | GAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAG  >  W3110S.gb/1221757‑1221817

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑