Missing coverage evidence...
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ATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAAT  >  W3110S.gb/1222190‑1222251                                                              | aTGTTATCAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:55482/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGGTGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:62572/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACGTGGtaat  >  1:68632/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:74008/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:59746/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:61692/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:68408/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:69931/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:73372/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:51429/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:76503/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:77655/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:77984/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:79405/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:80091/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:83481/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:86485/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:27141/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:14665/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:16651/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:18602/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:20636/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:20717/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:21389/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:21763/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:22530/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:11327/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:27710/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:27963/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:35363/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:38356/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:38658/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:4180/1‑62 (MQ=255) aTGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGtaat  >  1:46181/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAAT  >  W3110S.gb/1222190‑1222251

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑