Missing coverage evidence...
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ATGTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGCCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAG  >  W3110S.gb/1285712‑1285773                                                              | atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACAGTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:25434/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:69532/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:50145/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:58187/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:59686/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:62685/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:63135/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:63562/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:67729/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:47440/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:71348/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:71603/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:80011/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:81938/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:82137/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:85183/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:85323/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:25030/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:10461/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:13675/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:14478/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:14585/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:16690/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:21317/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:24927/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:10420/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:25794/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:25914/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:29982/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:43378/62‑1 (MQ=255) atgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:44416/62‑1 (MQ=255)  tgTATTTGGCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:61783/61‑1 (MQ=255)  tgTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:36855/61‑1 (MQ=255)                    gCGAACACTGTCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAg  <  1:19404/43‑1 (MQ=255)                                                              | ATGTATTTGCCGCGCCTGTGCGAACACTGCCTGAACCCGGCATGTGTGGCGACCTGCCCGAG  >  W3110S.gb/1285712‑1285773

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑