Missing coverage evidence...
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GTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGC  >  W3110S.gb/1607015‑1607076                                                              | gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:55234/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:83681/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:83643/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:83041/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:78030/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:77619/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:76455/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:76329/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:69751/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:65867/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:64454/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:64083/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:61109/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:59797/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:58231/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:56803/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:10214/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:48994/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:48646/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:48278/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:47971/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:46747/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:41642/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:38827/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:3523/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:28885/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:27084/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:22671/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:19043/62‑1 (MQ=255) gTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:11466/62‑1 (MQ=255)    ataACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAAcgc  <  1:39084/59‑1 (MQ=255)                                                              | GTTATAACGCCATTATCGTTTCTGCGGTTTCGCCTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGC  >  W3110S.gb/1607015‑1607076

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑