Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1643334	1651749	8416	38 [0]	[0] 32	cspF–ydfD	cspF,ydfT,ydfU,rem,hokD,relE,relB,ydfV,flxA,ydfW,ydfX,dicC,dicA,ydfA,ydfB,ydfC,dicB,ydfD

TTCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACTT  >  W3110S.gb/1643275‑1643333                                                           | ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:67509/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:43598/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:49719/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:50299/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:50876/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:52014/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:58799/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:6071/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:61876/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:4860/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:68743/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:68852/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:80759/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:82318/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:84583/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:85805/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:9005/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:976/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:26800/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:13515/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:13971/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:14961/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:17255/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:20810/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:21310/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:21792/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:21991/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:4027/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:28572/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:3520/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:37895/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:39945/59‑1 (MQ=255) ttCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:40022/59‑1 (MQ=255)  tCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:72788/58‑1 (MQ=255)    cTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:36456/56‑1 (MQ=255)             aGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:49726/47‑1 (MQ=255)                 tttCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:13410/43‑1 (MQ=255)                        aTAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACtt  <  1:38290/36‑1 (MQ=255)                                                           | TTCCTTAACTTGAGCCTTTCGGCATAAATGGTTTGCATAACAGAAACGACTTCGTACTT  >  W3110S.gb/1643275‑1643333

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑