Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1964615	1964775	161	54 [0]	[0] 16	[flhE]–[flhA]	[flhE],[flhA]

GTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACACTACT  >  W3110S.gb/1964553‑1964614                                                              | gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:59067/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:39671/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:42392/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:45593/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:45598/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:45681/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:47142/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:48480/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:49835/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:49962/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:50274/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:50919/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:55707/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:1224/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:59068/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:59504/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:59543/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:65251/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:66149/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:6774/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:7499/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:78610/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:81769/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:82056/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:82408/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:35995/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:10845/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:130/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:15069/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:17709/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:17759/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:20147/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:20830/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:25074/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:25445/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:25514/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:26139/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:2641/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:2887/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:30486/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:30976/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:31074/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:32281/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:32877/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:32883/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:34148/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:34396/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:34736/62‑1 (MQ=255) gTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:38502/62‑1 (MQ=255)  tataaaGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:74765/58‑1 (MQ=255)  tAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:2024/61‑1 (MQ=255)  tAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:46633/61‑1 (MQ=255)  tAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:84720/61‑1 (MQ=255)  tAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACactact  <  1:87597/61‑1 (MQ=255)                                                              | GTAGAAAGAGGCGCAGACGACATCGACTCACCGCGATGATTTAGCGTAATTCCTACACTACT  >  W3110S.gb/1964553‑1964614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑