Missing coverage evidence...
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CCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGC  >  W3110S.gb/2093858‑2093919                                                              | ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:14606/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:77924/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:75530/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:74653/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:72728/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:70000/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:67052/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:62203/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:60550/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:585/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:46517/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:45135/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:43702/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:40543/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:39676/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:36931/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:34642/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:30442/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:12492/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:267/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:15330/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:22000/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:21856/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:21723/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:16202/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:18670/62‑1 (MQ=255) ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTCGACGGTgcggc  <  1:56373/62‑1 (MQ=255)  cGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:33131/61‑1 (MQ=255)  cGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:19723/61‑1 (MQ=255)          gCCTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:81973/53‑1 (MQ=255)            cTTTGTCACCGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:29625/51‑1 (MQ=255)                     cGAAGCAAAACGCCAGGTAAGCCTGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:16177/42‑1 (MQ=25)                       aaGCAAAACGCCAGGTAAGCCAGCGTCTGGACGGTgcggc  <  1:23520/40‑1 (MQ=37)                                                              | CCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGC  >  W3110S.gb/2093858‑2093919

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑