Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2967230	2968164	935	82 [0]	[0] 16	[nudH]	[nudH]

TCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACACCACC  >  W3110S.gb/2967168‑2967229                                                              | tCACCCCACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:32389/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGATCTCTTTCATTACCCTGCGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:63110/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:67100/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:75257/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:73438/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:72545/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:72531/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:7197/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:71071/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:7066/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:70497/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:68905/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:75352/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:66067/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:65860/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:6531/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:65066/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:6404/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:63948/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:63748/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:62984/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:62064/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:84679/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:9427/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:923/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:9158/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:9087/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:87901/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:86084/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:85790/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:85226/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:85203/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:61959/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:84000/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:82873/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:80637/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:800/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:79723/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:79611/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:78344/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:77245/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:77039/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:28708/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:3829/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:3634/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:35828/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:34010/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:33978/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:33494/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:3039/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:30066/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:29475/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:39215/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:27774/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:25686/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:24455/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:21225/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:19495/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:16469/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:16425/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:1330/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:11464/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:44981/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:60397/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:58112/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:55875/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:54123/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:52003/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:51473/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:47602/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:46016/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:45099/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:10506/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:44903/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:44884/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:43339/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:42321/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:41943/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:41133/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:40915/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:40456/1‑62 (MQ=255) tCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACaccacc  >  1:40128/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCACCACACTCGCGAACTCTTTCATTACCCTACGGTAGACATCACGTTTAAATGACACCACC  >  W3110S.gb/2967168‑2967229

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑