Missing coverage evidence...
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TTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGT  >  W3110S.gb/3857384‑3857445                                                              | ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:56978/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:87323/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:82609/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:81316/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:80852/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:78970/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:77161/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:75171/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:7104/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:70918/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:6869/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:67841/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:67144/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:6373/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:60817/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:58446/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:25278/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:55307/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:49654/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:48509/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:46587/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:45125/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:43287/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:42388/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:40601/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:37506/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:32939/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:30812/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:30401/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:29399/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:27786/1‑62 (MQ=255) ttGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGt  >  1:25840/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGT  >  W3110S.gb/3857384‑3857445

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑