Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4091163	4093949	2787	57 [0]	[0] 37	[malQ]–gntT	[malQ],gntT

TACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCA  >  W3110S.gb/4091101‑4091162                                                              | tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGGATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:19275/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:65565/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:12785/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:49898/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:50183/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:51599/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:5503/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:55838/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:59245/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:60648/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:6225/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:63173/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:63444/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:64586/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:64968/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:48421/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:65635/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:67950/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:70660/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:70888/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:72329/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:74648/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:76133/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:84359/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:87208/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:9072/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:921/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:28330/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:13219/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:14685/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:16459/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:19018/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:19808/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:20251/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:21501/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:23681/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:25609/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:27605/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:47402/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:31101/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:32823/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:46900/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:45845/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:43923/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:38801/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:38433/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:36875/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:35245/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:3518/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:3318/62‑1 (MQ=255) tACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:32963/62‑1 (MQ=255)  aCTCCACGGTTAGCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGATTGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:68216/61‑1 (MQ=255)  aCTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:23182/61‑1 (MQ=255)  aCTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:57121/61‑1 (MQ=255)          gTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:72229/53‑1 (MQ=255)               cGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:64019/48‑1 (MQ=255)                          tGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCa  <  1:25529/37‑1 (MQ=255)                                                              | TACTCCACGGTTACCGCCCTAAAAATGACAGCATTACGAATGGCGTGGAAAGGTTTCGCGCA  >  W3110S.gb/4091101‑4091162

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑