Missing coverage evidence...
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CAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGG  >  W3110S.gb/4501339‑4501399                                                             | cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATTTCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:69015/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:69127/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:53558/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:53619/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:56922/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:59713/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:61884/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:62487/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:65696/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:53071/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:70890/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:72598/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:74381/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:74592/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:80084/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:80274/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:88008/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:88580/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:32523/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:15593/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:19713/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:21781/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:2216/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:22783/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:24782/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:29187/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:11555/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:33874/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:34536/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:36854/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:38612/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:38992/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:39752/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:46160/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:52472/1‑61 (MQ=255) cAACAGGGAGGGAATACGATGGCAATAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACgg  >  1:21655/1‑61 (MQ=255)                                                             | CAACAGGGAGGGAATACGATGGCATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGG  >  W3110S.gb/4501339‑4501399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑