Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	554229	554451	223	17 [0]	[1] 62	cysS	cysteinyl‑tRNA synthetase

CATTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCACGGCGGCGG  >  W3110S.gb/554451‑554513  |                                                              caTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCT‑GGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:55616/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:71249/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:55723/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:57996/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:58046/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:59955/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:6087/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:6178/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:62736/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:63151/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:64333/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:64342/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:64959/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:69078/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:7045/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:70957/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:9772/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:71932/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:72466/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:7277/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:75328/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:76061/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:77605/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:78483/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:79212/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:79256/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:80824/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:81056/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:81699/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:8251/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:82779/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:1131/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:38510/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:11422/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:12844/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:14761/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:1516/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:16306/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:18207/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:19299/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:20939/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:26260/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:27734/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:32888/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:33221/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:36863/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:55499/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:3895/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:40545/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:4133/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:42431/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:44658/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:44719/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:46705/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:47399/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:47941/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:48200/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:49033/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:53430/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:54670/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:54793/62‑1 (MQ=255)  aTTGAATGTTCGGCAATCAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCAcggcggcgg  <  1:17615/62‑1 (MQ=255)  |                                                              CATTGAATGTTCGGCAATGAACTGCAAGCAGCTGGGTAACCACTTTGATATCCACGGCGGCGG  >  W3110S.gb/554451‑554513

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑