Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1040239 1041692 1454 112 [0] [0] 45 [appB]–[appA] [appB],[appA]

GAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCT  >  W3110S.gb/1041693‑1041754
|                                                             
gAACTCAAGGTTAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:24317/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCTGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:64445/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCTGTAAGCCTCGCATCAATGc   >  1:3872/1‑61 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTa                   >  1:14174/1‑45 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGc                >  1:78973/1‑48 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCAtg        >  1:27575/1‑55 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGc   >  1:46384/1‑61 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:67928/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:63146/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:68140/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:68982/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:69548/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:70045/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:70723/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:717/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:7199/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:74287/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:76496/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:77338/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:77474/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:7926/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:79308/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:83962/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:8400/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:85461/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:8975/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:39316/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:14053/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:14938/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:21880/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:26284/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:26309/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:3024/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:33065/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:35658/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:37628/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:66992/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:43051/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:45258/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:48518/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:53211/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:61456/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:62033/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1095/1‑62 (MQ=255)
gAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:64332/1‑62 (MQ=255)
|                                                             
GAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCT  >  W3110S.gb/1041693‑1041754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: