Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1392060 1394232 2173 11 [0] [0] 33 [mpaA]–[ycjZ] [mpaA],ymjC,ycjY,[ycjZ]

CGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATC  >  W3110S.gb/1394233‑1394293
|                                                            
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGTAATTAATTTGTATc  <  1:54271/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:685/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:49804/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:57179/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:58463/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:59405/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:59916/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:62099/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:64158/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:49366/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:71863/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:75048/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:77829/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:82755/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:86021/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:87146/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:9994/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:12078/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:49299/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:49267/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:47869/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:46907/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:42385/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:4070/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:37637/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:36724/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:27043/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:25530/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:20382/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:19387/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:18604/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:18503/61‑1 (MQ=255)
cGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc  <  1:12411/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
CGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATC  >  W3110S.gb/1394233‑1394293

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: