Missing coverage evidence...
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CCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCG  >  W3110S.gb/2271415‑2271469 |                                                       ccAGACCGCTTGTTGATAGCGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:68136/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:67339/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:48324/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:52653/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:53096/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:59431/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:61427/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:65045/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:6573/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:66171/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:66970/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:43773/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:69149/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:74330/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:74568/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:77453/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:81598/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:85470/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:9388/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:30527/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:19123/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:20801/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:24298/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:24999/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:27011/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:27056/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:2806/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:30525/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:17721/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:32299/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:32762/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:34100/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:35372/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:35505/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:36657/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:40107/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:41445/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:41454/55‑1 (MQ=255) ccAGACCGCTTGTTGATAGACCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCg  <  1:86605/55‑1 (MQ=255) |                                                       CCAGACCGCTTGTTGATAGAGCCGACCGGGCTGGGCCATCCGAAACAGATCCTCG  >  W3110S.gb/2271415‑2271469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑