Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2317288	2318909	1622	69 [0]	[2] 25	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

AATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGG  >  W3110S.gb/2318909‑2318971  |                                                              aaTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAG‑TAGAAAATTgggg  <  1:32429/62‑1 (MQ=255) aaTGGTGGATGTTACTT‑GGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:33572/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGTAAATTgggg  <  1:1619/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:2776/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:9378/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:86324/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:80925/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:80794/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:79144/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:76961/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:47987/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:47860/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:37218/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:10295/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:27512/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:27303/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:26966/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:25289/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:24720/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:2457/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:22275/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:20538/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:13816/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:10713/62‑1 (MQ=255)  aTGGTGGATGTTACTTCCGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTgggg  <  1:6505/62‑1 (MQ=255)  |                                                              AATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGG  >  W3110S.gb/2318909‑2318971

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑