Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2968227	2970888	2662	16 [0]	[0] 98	mutH–[tas]	mutH,ygdQ,ygdR,[tas]

CGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAC  >  W3110S.gb/2970889‑2970940 |                                                    cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCa                   >  1:9942/1‑35 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAgggg        >  1:61398/1‑46 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAgg          >  1:9908/1‑44 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAg           >  1:88238/1‑43 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:6857/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:10985/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:65338/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:64043/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:62966/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:61711/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:60686/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:59979/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:59352/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:59115/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:58924/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:58826/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:58240/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:57388/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:56237/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:55423/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:54990/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:52242/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:51262/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:5049/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:49842/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:4946/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:78180/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:9900/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:8770/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:85996/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:85076/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:84572/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:84181/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:83189/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:82745/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:80740/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:80172/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:78434/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:69282/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:7745/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:76600/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:75701/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:74448/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:73157/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:73005/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:72703/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:72205/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:72170/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:72058/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:20169/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:31369/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:30340/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:28815/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:2743/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:257/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:25277/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:24481/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:24094/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:22037/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:20479/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:20210/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:32271/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:19940/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:1952/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:18330/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:18112/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:1758/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:16542/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:15335/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:14361/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:12900/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:11274/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:11063/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:39382/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:47792/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:47081/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:45792/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:45139/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:44621/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:43440/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:43181/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:43019/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:41838/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:41404/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:4134/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:40900/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:49259/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:38148/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:37930/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:37474/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:37164/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:36655/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:36561/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:35476/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:35439/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:33139/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:33098/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTCTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAc  >  1:76983/1‑52 (MQ=255) |                                                    CGCAGTTTTGAAGTAGGTCTGGCAGAAGTCAGCCAGTATGAAGGGGTCGAAC  >  W3110S.gb/2970889‑2970940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑