Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3416897	3417014	118	5 [0]	[0] 43	acrF	multidrug efflux system protein

GCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACACC  >  W3110S.gb/3417015‑3417056 |                                          gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCTTGGAAGACAcc  >  1:14446/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGacac   >  1:8964/1‑41 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:48561/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:47300/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:50828/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:51106/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:51239/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:61696/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:65292/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:65632/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:66500/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:69828/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:71038/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:7138/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:73553/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:76430/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:7646/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:79677/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:87247/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:87281/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:87360/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:34834/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:1426/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:14549/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:16438/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:20791/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:22179/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:27976/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:28654/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:30276/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:31707/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:11600/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:36577/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:36922/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:3732/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:42324/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:42923/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:43777/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:43951/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:44683/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:46775/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCATGGAAGACAcc  >  1:55057/1‑42 (MQ=255) gCCAGCTTAGTCAGCGTGAGCCCTAATGGCCTGGAAGACAcc  >  1:71868/1‑42 (MQ=255) |                                          GCCAGCTTAGTCAGCGTGCGCCCTAATGGCCTGGAAGACACC  >  W3110S.gb/3417015‑3417056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑