Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3887627	3894442	6816	31 [0]	[0] 42	[yiaU]–[yiaN]	[yiaU],yiaT,sgbE,sgbU,sgbH,lyxK,yiaO,[yiaN]

CATCGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTA  >  W3110S.gb/3894443‑3894504 |                                                              catcGAATTTGAGTTTTGCCCCCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:17102/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGa             >  1:75108/1‑51 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAg          >  1:17969/1‑54 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGc        >  1:54400/1‑56 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGgtgt   >  1:55304/1‑61 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGgtgt   >  1:85949/1‑61 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGgtgt   >  1:58299/1‑61 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGgtgt   >  1:43122/1‑61 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:75648/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:58685/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:6088/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:6308/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:63877/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:68061/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:72514/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:74259/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:18383/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:20434/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:75758/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:76842/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:76918/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:77915/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:82165/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:85289/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:15845/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:53179/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:36837/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:37546/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:39011/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:42163/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:44599/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:5055/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:36270/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:53197/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:53229/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:25304/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:10400/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:55653/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:55685/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:57786/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGAGGTGTa  >  1:4991/1‑62 (MQ=255) catcGAATTTGAGTTTTGCAACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTa  >  1:25847/1‑62 (MQ=255) |                                                              CATCGAATTTGAGTTTTGCCACCCCTGAAATAACGTTAAGTACATTACCGATAGGCGGTGTA  >  W3110S.gb/3894443‑3894504

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑