Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,648,8170CA55.3% 14.4 / 73.0 85L7I (CTC→ATC) hemYpredicted protoheme IX synthesis protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (38/0);  new base A (47/0);  total (85/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

GCCGCGCCGCAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCG  >  W3110S.gb/3648776‑3648837
                                         |                    
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGGTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:51946/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTtgt               >  1:26470/1‑49 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:33651/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:10194/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:78188/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:77701/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:37987/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:38314/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:77496/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:76725/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:42480/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:74601/1‑62 (MQ=255)
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gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:45323/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:47357/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:48796/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:53853/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:54788/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:70122/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:59456/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:62574/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:64468/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:66449/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:88094/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:83047/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:82211/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:82121/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:81986/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:283/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:83150/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:83979/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:9162/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:160/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:31139/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:80482/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:9675/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:33565/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGc          >  1:5421/1‑54 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:67170/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:70364/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:9731/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:69640/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:81714/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:70812/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:71966/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:73518/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:81092/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:80706/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:75149/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:8048/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:80286/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:79692/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:79589/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:32351/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:12432/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:12967/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:1818/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:2054/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:21485/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:23966/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:2406/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:24659/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:24844/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:28358/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:294/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:30937/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:31469/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:31782/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:67145/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:32361/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:33307/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:3690/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:36974/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:39766/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:41203/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:41705/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:42644/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:43190/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:43315/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:43846/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:56858/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:58050/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:66918/1‑62 (MQ=255)
gccgcgccgcAAGGAGAACAACCATGCTAAAAGTGTTATTGATCTTTGTGTTGCTGATTGCg  >  1:22669/1‑62 (MQ=255)
                                         |                    
GCCGCGCCGCAAGGAGAATAACCATGCTAAAAGTGTTATTGCTCTTTGTGTTGCTGATTGCG  >  W3110S.gb/3648776‑3648837

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑