| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 3,851,689 | 0 | G | T | 25.6% | 153.4 / 46.7 | 121 | P210T (CCT→ACT) | yibQ | predicted polysaccharide deacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/90); new base T (0/31); total (0/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.89e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GCAGGGTGAGGATGCCCAATGGCAATGGTCGAACCGTTGCGACGCGCCAGGTCAATTGCGCG > W3110S.gb/3851679‑3851740 | gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:21612/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:37445/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:76093/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:33097/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:39331/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:40730/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:30048/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:28429/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:4323/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:26352/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:69777/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:83489/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:10090/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:55183/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:53950/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:50639/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:63265/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:86208/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:5364/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCTAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:23911/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGGATTGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:2509/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:70930/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:57092/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:38412/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:71208/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:39041/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:59598/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:65361/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:51624/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:49908/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:76261/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:47185/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:65685/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:79533/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:83638/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:84168/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:20346/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:86797/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:87848/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:7904/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:786/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:7800/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:31100/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:87903/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACCTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:55223/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:66035/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:8650/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:85524/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:8541/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:85073/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:88466/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:83492/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:74284/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:82684/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:67864/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:68534/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:68765/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:70653/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:77115/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:76673/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:49667/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:1936/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:31406/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:30790/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:26581/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:26456/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:23314/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:21526/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:2104/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:20331/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:19639/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:31654/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:18540/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:17663/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:17587/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:16940/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:14720/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:14382/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:14013/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:13422/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:13032/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:46461/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:52057/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:49426/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:46537/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:53346/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:46173/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:44540/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:44446/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:3892/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:35152/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:33285/60‑1 (MQ=255)gaaGGGTGAGGATATACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGTCGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:68343/60‑1 (MQ=255) aaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:41115/60‑1 (MQ=255) aaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:6805/60‑1 (MQ=255) aaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:37014/60‑1 (MQ=255) aaGGGTGAGTATGTCCAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:49433/60‑1 (MQ=255) aaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:4804/60‑1 (MQ=255) aaGGGTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:65193/60‑1 (MQ=255) gTGAGGATGTACAATGGCAATGGTTGAACCGTTGCGACGTGCCAGGTCAATTGcgcg < 1:66611/57‑1 (MQ=255) | GCAGGGTGAGGATGCCCAATGGCAATGGTCGAACCGTTGCGACGCGCCAGGTCAATTGCGCG > W3110S.gb/3851679‑3851740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |