Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	651,742	T→C	F95F (TTT→TTC)	citA →	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with citB

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	651,742	0	T	C	100.0%	85.2 / NA	47	F95F (TTT→TTC)	citA	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with citB
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/47);  total (0/47)

TAACAAATTACAAAGAGATACCGATTTTGATTATGTGGTGATTGGGGACCGGCACTCGATC  >  W3110S.gb/651715‑651775                            |                                  tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCTATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:47000/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:6291/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:47660/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:4988/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:50089/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:57921/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:58347/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:58639/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:59177/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:59724/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:61247/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:61907/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:9907/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:65262/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:66619/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:67970/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:68132/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:77348/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:78426/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:81626/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:83540/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:84400/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:87063/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:10571/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:30726/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:12094/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:13207/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:16021/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:16068/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:16789/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:18890/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:20260/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:23209/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:25269/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:27385/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:27978/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:43851/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:30824/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:31259/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:32960/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:32983/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:33611/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:37494/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:41580/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:42016/59‑2 (MQ=255) tgaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:43592/59‑2 (MQ=255)  gaCAAATTACAAAGAGATACTGATTTCGATTATGTGGTGATTGGCGATCGGCACTCGAtt  <  1:60039/59‑2 (MQ=255)                            |                                  TAACAAATTACAAAGAGATACCGATTTTGATTATGTGGTGATTGGGGACCGGCACTCGATC  >  W3110S.gb/651715‑651775

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑