Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	50,558	C→T	S222N (AGC→AAC)	apaH ←	diadenosine tetraphosphatase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	50,558	0	C	T	100.0%	126.6 / NA	68	S222N (AGC→AAC)	apaH	diadenosine tetraphosphatase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (68/0);  total (68/0)

TATATACCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGCTG  >  W3110S.gb/50501‑50560                                                          |   taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:54222/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:59825/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:58148/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:5794/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:56532/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:56160/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:5449/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:54423/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:54325/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:6083/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:53848/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:52672/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:51617/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:51363/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:51251/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:49312/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:47997/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:7219/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:9519/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:84677/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:83427/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:82482/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:79813/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:77478/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:72471/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:72326/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:47680/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:70997/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:70740/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:68021/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:65273/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:63453/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:62274/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:60839/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:18755/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:10685/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:2546/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:25413/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:24820/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:23469/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:22770/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:19989/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:19056/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:28746/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:17631/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:17164/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:16239/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:14808/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:13165/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:12697/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:11533/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:31934/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:47534/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:45399/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:44592/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:44524/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:43573/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:42270/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:41802/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:36710/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:36170/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:36147/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:35280/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:33749/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:32752/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:30259/4‑60 (MQ=255) taaataCCTTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGACCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:1482/4‑60 (MQ=255) taaataCATTCCGGCGTACCTTTGCCTTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGTTg  >  1:3962/4‑60 (MQ=255)                                                          |   TATATACCTTCCGGCGTACCTTTGCCCTCCAGCGATGCCCAGTGACCAAAGGCGATGCTG  >  W3110S.gb/50501‑50560

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑