Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	664,905	A→G	S236S (AGT→AGC)	rlpA ←	minor lipoprotein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	664,905	0	A	G	100.0%	152.0 / NA	78	S236S (AGT→AGC)	rlpA	minor lipoprotein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/78);  total (0/78)

GTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTT  >  W3110S.gb/664879‑664938                           |                                  ggcGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:68476/58‑1 (MQ=255) ggcGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:14179/58‑1 (MQ=255) ggcGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:18064/58‑1 (MQ=255) ggcGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:75414/58‑1 (MQ=255) ggcGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGAGCTTCGCtt  <  1:42340/58‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTGCGCCTAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:4569/60‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:53072/60‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:66030/60‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTGCTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCtt  <  1:63840/60‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑