Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	670,108	T→A	Q74H (CAA→CAT)	cobC ←	predicted alpha‑ribazole‑5'‑P phosphatase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	670,108	0	T	A	100.0%	147.5 / NA	84	Q74H (CAA→CAT)	cobC	predicted alpha‑ribazole‑5'‑P phosphatase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (84/0);  total (84/0)

CGCGATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCGTTGAGTTCAGGTATGATTTGC  >  W3110S.gb/670050‑670111                                                           |    cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAGAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:62254/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:64611/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:70786/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:70377/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:69094/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:68457/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:68365/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:67801/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:67686/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:66672/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:66667/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:71336/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:63920/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:62667/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:62657/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:62156/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:61709/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:60204/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:12350/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:58508/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:83325/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:9937/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:9681/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:9074/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:88427/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:87807/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:86195/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:86098/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:86096/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:85553/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:59180/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:80105/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:79205/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:78518/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:78059/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:7716/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:74542/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:72832/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:72731/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:71839/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:25836/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:37269/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:33299/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:33092/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:33049/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:2977/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:28981/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:28411/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:28224/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:26847/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:36422/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:25034/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:24982/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:23896/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:21958/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:19851/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:19757/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:1694/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:15008/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:13176/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:386/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:56948/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:52861/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:39742/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:41204/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:4965/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:49640/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:4152/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:42469/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:49401/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:42592/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:48226/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:43203/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:47054/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:47087/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATg   >  1:39445/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATg   >  1:85915/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATg   >  1:41500/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATg   >  1:32190/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATg   >  1:57844/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGAAGATATga  >  1:78650/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTAAGGGATGATATga  >  1:68499/3‑61 (MQ=255) cacgATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGGTCAGGGATGATATga  >  1:54920/3‑61 (MQ=255) cacgAAGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCATTGAGTTCAGGGATGATATga  >  1:64786/3‑61 (MQ=255)                                                           |    CGCGATGATGTCGCATCTCCCAGTCGCCAAAAAACATTTCGTTGAGTTCAGGTATGATTTGC  >  W3110S.gb/670050‑670111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑