Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 714,804 C→T G275G (GGC→GGT pgm → phosphoglucomutase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb714,8040CT98.0% 79.6 / ‑6.5 49G275G (GGC→GGTpgmphosphoglucomutase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base T (0/48);  minor base G (0/1);  total (0/49)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

TGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGG  >  W3110S.gb/714792‑714853
            |                                                 
cgATAAAGCCGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:35174/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:70250/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:57588/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:58801/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:59937/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:60044/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:63955/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:64757/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:64932/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:64942/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:65806/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:66792/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:68432/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:69938/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:15709/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:71841/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:76420/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:77414/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:77442/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:78930/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:80831/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:81365/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:82991/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:85001/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:907/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:37748/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:10067/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:18357/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:18961/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:19068/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:20288/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:21591/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:22010/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:2569/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:28403/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:38491/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:41668/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:4317/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:43404/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:44148/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:45184/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:45834/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:46888/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:50011/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:53776/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:54164/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCGCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:87703/61‑1 (MQ=255)
cgATAAAGACGGGGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:54520/61‑1 (MQ=255)
 gATAAAGACGGTGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg  <  1:37436/61‑1 (MQ=255)
            |                                                 
TGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGG  >  W3110S.gb/714792‑714853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: