Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	719,583	G→A	L434L (CTG→TTG)	speF ←	ornithine decarboxylase isozyme, inducible

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	719,583	0	G	A	100.0%	124.2 / NA	69	L434L (CTG→TTG)	speF	ornithine decarboxylase isozyme, inducible
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (69/0);  total (69/0)

ACGAATATGCTGACAGTTATCGAGGATCAGTTTGCGGGCATT  >  W3110S.gb/719554‑719595                              |             gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:519/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:62224/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:61690/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:59942/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:5901/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:57598/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:57425/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:53395/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:53093/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:6412/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:51622/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:51089/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:49821/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:49644/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:49339/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:47843/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:4634/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:45168/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:78304/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:9212/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:86049/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:85895/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:85129/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:82218/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:81774/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:80808/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:78729/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:44102/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:77445/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:77359/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:77210/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:71365/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:69905/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:67354/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:64165/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:14865/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:24191/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:23768/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:22376/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:22344/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:21648/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:20786/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:18948/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:16369/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:2427/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:14577/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:14006/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:12714/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:1247/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:12464/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:11436/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:11386/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:30756/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:43373/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:4259/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:41854/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:39827/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:36630/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:36363/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:3557/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:31069/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:11362/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:30354/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:29815/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:28230/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:25449/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:2534/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:24836/2‑42 (MQ=37) gcGAATGTGCTGGCAGTTATCGAGGATCAATTTGCGGGCAtt  >  1:24527/2‑42 (MQ=37)                              |             ACGAATATGCTGACAGTTATCGAGGATCAGTTTGCGGGCATT  >  W3110S.gb/719554‑719595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑