Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 720,211 G→A H224H (CAC→CAT speF ← ornithine decarboxylase isozyme, inducible

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb720,2110GA100.0% 106.8 / NA 61H224H (CAC→CATspeFornithine decarboxylase isozyme, inducible
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (61/0);  total (61/0)

GGTGTTGCACCAGCCTGTAGCAACGCTCCGTGGTGGTTAGATTTGTGGTTATTGCGATCA  >  W3110S.gb/720167‑720226
                                            |               
ggTGTTGCTCCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:3013/1‑60 (MQ=21)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTtatg               >  1:32723/1‑47 (MQ=255)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCgg     >  1:39347/1‑56 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:71139/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:75190/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:74295/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:73449/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:73030/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:72937/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:77991/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:70383/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:68896/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:65535/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:65331/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:6501/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:64347/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:64245/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:77823/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:60819/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:79862/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:8045/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:80818/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:81061/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:81257/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:8152/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:8188/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:82071/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:84088/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:85743/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:86770/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:87260/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:9435/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:33940/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:14411/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:15274/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:16487/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:2178/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:22089/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:22116/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:22489/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:23060/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:27510/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:29466/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:32477/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:33177/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:62001/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:3442/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:36869/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:39334/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:42538/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:42874/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:47337/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:47976/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:48069/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:52111/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:52353/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:57110/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:60313/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:10402/1‑60 (MQ=25)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTACACATATGGTTATTGCGGTCa  >  1:71518/1‑60 (MQ=255)
ggTGTTGCACCAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGCTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:21879/1‑60 (MQ=255)
ggTGTTGCACAAGCCTGTAGCAAGGCCCCGTGATGGTTAGACTTATGGTTATTGCGGTCa  >  1:22041/1‑60 (MQ=21)
                                            |               
GGTGTTGCACCAGCCTGTAGCAACGCTCCGTGGTGGTTAGATTTGTGGTTATTGCGATCA  >  W3110S.gb/720167‑720226

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: