Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 729,608 A→G Y18C (TAT→TGT)  ybfA → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb729,6080AG100.0% 109.8 / NA 57Y18C (TAT→TGT) ybfAhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/57);  total (0/57)

AAGTATGGAACTCTACAGAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTATGCG  >  W3110S.gb/729552‑729612
                                                        |    
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aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:57356/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:58728/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:59140/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:64685/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:66083/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:6648/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:66687/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:67290/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:67383/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:51665/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:69495/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:70363/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:73134/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:73676/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:75598/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:77659/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:78276/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:79145/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:81492/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:82311/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:84478/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:8766/61‑1 (MQ=255)
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aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:11384/61‑1 (MQ=255)
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aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:20624/61‑1 (MQ=255)
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aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:2290/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:48472/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:24494/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:26243/61‑1 (MQ=255)
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aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:28571/61‑1 (MQ=255)
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aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:34572/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:34859/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:35985/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:40275/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:41001/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:46758/61‑1 (MQ=255)
aaGTATGGAACTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:47611/61‑1 (MQ=255)
         aCTCTACAAAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:68960/52‑1 (MQ=255)
                         ccTGGATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTGTGCg  <  1:67429/36‑1 (MQ=37)
                                                        |    
AAGTATGGAACTCTACAGAGAATATCCTGCATGGCTTATCTTTTTACGCCGTACTTATGCG  >  W3110S.gb/729552‑729612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: