Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 742,634 G→A G115G (GGC→GGT)  ybgH ← predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb742,6340GA98.7% 129.9 / NA 75G115G (GGC→GGT) ybgHpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base A (74/0);  minor base C (1/0);  total (75/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

TTTAAACAGGCCATAGCCGCAGACGATAATCGCCAGGGACAGATAGAGGAATGACGGATGGA  >  W3110S.gb/742625‑742686
         |                                                    
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tttAAACAGACCATAGCCGCAGACGATAATCGCCAGGGACAGATAGAGGAATGACggatgg   >  1:86421/1‑61 (MQ=255)
tttAAACAGACAATAGCCGCAGACGATAATCGCCAGGGACAGATAGAGGAATGACggatgga  >  1:12863/1‑62 (MQ=255)
         |                                                    
TTTAAACAGGCCATAGCCGCAGACGATAATCGCCAGGGACAGATAGAGGAATGACGGATGGA  >  W3110S.gb/742625‑742686

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑