Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 786,222 T→G V56V (GTT→GTG aroG → 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, phenylalanine repressible

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb786,2220TG100.0% 161.0 / NA 83V56V (GTT→GTGaroG3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, phenylalanine repressible
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (0/83);  total (0/83)

AAAGCGATCCATAAGATCCTGAAAGGTAATGATGATCGCCTGTTGGTTGTGATTGGCCCATG  >  W3110S.gb/786175‑786236
                                               |              
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                                               |              
AAAGCGATCCATAAGATCCTGAAAGGTAATGATGATCGCCTGTTGGTTGTGATTGGCCCATG  >  W3110S.gb/786175‑786236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: