Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 66,476 T→G T25T (ACA→ACC)  araD ← L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb66,4760TG98.7% 143.4 / ‑5.4 75T25T (ACA→ACC) araDL‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base G (0/74);  minor base C (0/1);  total (0/75)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01

GCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTG  >  W3110S.gb/66440‑66501
                                    |                         
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 ccgcGCCCGCGATCAACGGCGCTGACATTGCCCCAGGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTg  <  1:48898/61‑1 (MQ=37)
 ccgcGCCCGCGATCAACGGCGCTGACATTGCCCCAGGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTg  <  1:11347/61‑1 (MQ=37)
                                    |                         
GCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTG  >  W3110S.gb/66440‑66501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑