Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	802,668	C→T	I120I (ATC→ATT)	ybhI →	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	802,668	0	C	T	98.5%	116.5 / ‑5.6	67	I120I (ATC→ATT)	ybhI	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base T (0/66);  minor base A (0/1);  total (0/67)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01

TATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTGG  >  W3110S.gb/802648‑802690                     |                       tATCTGCTGATTGGTAATATTGGTAGCACTACCctgtgtctgg  <  1:53687/43‑1 (MQ=16) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:6229/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:43816/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:46027/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:46422/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:48186/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:48429/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:48657/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:49900/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:5185/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:52779/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:54085/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:54517/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:55994/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:57861/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:59/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:11260/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:63907/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:64431/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:66134/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:67503/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:69297/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:69596/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:70031/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:72040/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:74402/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:83251/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:86199/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:86374/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:86383/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:86765/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:88026/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:3968/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:10292/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:12751/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:1324/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:15260/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:16044/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:16656/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:18805/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:19141/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:19361/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:19467/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:21567/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:21775/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:23582/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:25021/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:25608/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:3111/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:39248/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:38207/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:37865/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:35420/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:34719/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:33190/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:25930/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:30885/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:30291/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:30011/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:43375/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:29202/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:28217/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:26323/43‑1 (MQ=25) tATCTGCTGATTGGTAAAATAGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:72878/43‑1 (MQ=25)  aTCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:51420/42‑1 (MQ=25)   tCTGCTGATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:22138/41‑1 (MQ=25)     tgctgATTGGTAAAATTGGTAGCACTACCctgggtctgg  <  1:9037/39‑1 (MQ=25)                     |                       TATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTGG  >  W3110S.gb/802648‑802690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑