Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 827,642 T→C V11V (GTA→GTG ybhS ← predicted transporter subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb827,6420TC100.0% 93.4 / NA 52V11V (GTA→GTGybhSpredicted transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/52);  total (0/52)

ACAGCGCCCGTACGCGACGCCAGGACAGGATCGGGTTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAG  >  W3110S.gb/827632‑827694
          |                                                    
acaGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTATCCCAg  <  1:4146/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCATGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:45891/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTGATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:30978/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:67328/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:50275/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:56265/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:56470/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:58293/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:63037/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:64579/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:64708/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:65556/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:66367/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:66436/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:45452/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:68504/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:68901/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:69099/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:69785/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:72402/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:77270/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:77955/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:83556/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:85543/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:86582/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:87879/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:38440/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:23183/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:25179/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:25592/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:29210/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:29914/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:3035/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:33121/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:1212/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:3415/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:36243/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:38737/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:21279/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:19666/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:15318/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:40029/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:40032/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:14065/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:43016/62‑1 (MQ=255)
 caGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:13699/62‑1 (MQ=255)
  aGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:33172/61‑1 (MQ=255)
  aGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:64061/61‑1 (MQ=255)
  aGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:39410/61‑1 (MQ=255)
  aGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:6289/61‑1 (MQ=255)
  aGCGCCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:42927/61‑1 (MQ=255)
     gcCCGCACGCGACGCCAGGACAGGATCGGATTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAg  <  1:43198/58‑1 (MQ=255)
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ACAGCGCCCGTACGCGACGCCAGGACAGGATCGGGTTACTCATTGCTATGCTCCTTATCCCAG  >  W3110S.gb/827632‑827694

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: