Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	906,420	C→T	E252E (GAG→GAA)	ybjS ←	predicted NAD(P)H oxidoreductase with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	906,420	0	C	T	100.0%	171.0 / NA	94	E252E (GAG→GAA)	ybjS	predicted NAD(P)H oxidoreductase with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/94);  total (0/94)

TACGACAGTCAATATTCAACTCGTCGATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGC  >  W3110S.gb/906401‑906462                    |                                           tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:42405/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:510/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:82485/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:4772/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:47009/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:45790/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:45474/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:44458/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:43512/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:42876/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:52751/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:41351/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:40840/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:40203/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:39806/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:39720/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:3912/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:37648/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:36915/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:81112/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:77120/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:75993/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:78925/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:7133/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:67310/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:66151/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:63092/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:61830/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:38574/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:60216/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:81299/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:59458/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:81410/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:5894/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:57592/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:56386/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:54840/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:18021/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:23901/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:23682/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:23132/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:22994/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:84862/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:20275/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:20043/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:88565/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:18738/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:34535/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:17510/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:16660/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:15090/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:14668/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:14267/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:13188/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:11948/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:116/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:10456/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:83617/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:36225/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:34421/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:33661/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:83600/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:32736/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:31271/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:29587/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:27244/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:26004/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:25397/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:25356/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:84244/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:24662/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:24042/62‑1 (MQ=255) tACGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGAGATGc  <  1:32600/62‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCTATATTCAATTCGTCTATGAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:59653/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTTAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:51639/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:82/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:79154/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:82896/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:8898/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:7874/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:74483/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:6221/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:59759/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:59375/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:50901/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:48153/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:32865/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:24723/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:21463/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:19825/61‑1 (MQ=255)  aCGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:11530/61‑1 (MQ=255)   cGACAGTCAATATTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:28840/60‑1 (MQ=255)           tatatTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:61729/51‑1 (MQ=39)             tatTCAATTCGTCTATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGc  <  1:48521/50‑1 (MQ=39)                    |                                           TACGACAGTCAATATTCAACTCGTCGATCAGCTTCTGCACGATGCTGCGCAGTGTGCGATGC  >  W3110S.gb/906401‑906462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑