Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,504 C→T L390L (CTG→TTG)  thrA → fused aspartokinase I and homoserine dehydrogenase I

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,5040CT100.0% 127.4 / NA 69L390L (CTG→TTG) thrAfused aspartokinase I and homoserine dehydrogenase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (69/0);  total (69/0)

AAGGCTTACTGGAGCCGCTGGCAGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCGGTGGTAGGTGAT  >  W3110S.gb/1487‑1548
                 |                                            
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCa                      >  1:87418/1‑42 (MQ=37)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTAtct                >  1:11983/1‑48 (MQ=38)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:53135/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:6527/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:6526/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:63621/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:6148/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:60633/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:60400/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:59908/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:54981/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:72810/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:52351/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:51548/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:51375/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:50529/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:50262/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:44487/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:65670/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:44081/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:732/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:73301/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:73860/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:73945/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:74909/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:79660/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:81356/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:81933/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:85373/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:86631/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:86674/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:8912/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:9270/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:9723/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:21750/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:28081/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:27996/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:27773/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:25903/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:23250/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:23159/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:2219/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:22170/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:43158/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:1985/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:1539/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:13263/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:11776/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:11035/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:10840/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:10498/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:39910/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:10406/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:42789/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:42441/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:41792/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:41791/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:40391/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:39794/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:36138/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:34440/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:34013/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:30920/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:29865/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:28087/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCGGTGGTAGGAGAt  >  1:84773/1‑62 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCCGTTGGCCGTGACGGAACGGCTCGCCAATa                   >  1:68527/1‑45 (MQ=21)
aagGTTTACTGGAGCCGTTCGCGGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCggtggt         >  1:41381/1‑55 (MQ=255)
aagGTTTACTGGAGCAGTTGGCGGTGACGGAACgg                             >  1:35161/1‑35 (MQ=12)
                 |                                            
AAGGCTTACTGGAGCCGCTGGCAGTGACGGAACGGCTGGCCATTATCTCGGTGGTAGGTGAT  >  W3110S.gb/1487‑1548

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: