Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 962,758 C→T G114G (GGC→GGT)  rpsA → 30S ribosomal subunit protein S1

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb962,7580CT100.0% 158.7 / NA 85G114G (GGC→GGT) rpsA30S ribosomal subunit protein S1
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (85/0);  total (85/0)

GTTATCAACGGCAAAGTTAAGGGCGGCTTCACTGTTGAGCTGAACGGTATTCGTGCGTTCCT  >  W3110S.gb/962747‑962808
           |                                                  
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gtTATCAACGGTAAGGTTAAAGGCGGCTTCACTGTCGACGTTAACGGCATCCGTGCGTTCCt  >  1:54974/1‑62 (MQ=255)
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           |                                                  
GTTATCAACGGCAAAGTTAAGGGCGGCTTCACTGTTGAGCTGAACGGTATTCGTGCGTTCCT  >  W3110S.gb/962747‑962808

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑