Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	138,021	T→G	P313P (CCT→CCG)	cueO →	multicopper oxidase (laccase)

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	138,021	0	T	G	100.0%	100.6 / NA	55	P313P (CCT→CCG)	cueO	multicopper oxidase (laccase)
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (55/0);  total (55/0)

CTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGATAAGCCTCATCC  >  W3110S.gb/137965‑138026                                                         |      cTGGTGCCGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:4389/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:66350/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:4825/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:51495/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:52444/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:55356/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:5590/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:57345/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:57992/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:5892/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:59121/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:64407/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:651/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:65562/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:47614/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:68835/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:69736/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:70718/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:73343/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:74693/1‑62 (MQ=255) 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cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:36649/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:36693/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:38419/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:39127/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:3942/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:40855/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:40952/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:42584/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:43266/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:44508/1‑62 (MQ=255) cTGGTGACGCTGCCGGTCAGCCAGATGGGGATGGCGATTGCGCCGTTTGACAAGCCGCATcc  >  1:46832/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑