Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,040,185 G→A E156E (GAG→GAA)  appB → cytochrome bd‑II oxidase, subunit II

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,040,1850GA100.0% 211.5 / NA 110E156E (GAG→GAA) appBcytochrome bd‑II oxidase, subunit II
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/110);  total (0/110)

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

GCGTGGAGTATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATT  >  W3110S.gb/1040178‑1040238
       |                                                     
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gcgTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:62217/61‑1 (MQ=255)
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gcgTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:5615/61‑1 (MQ=255)
gcgTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:68150/61‑1 (MQ=255)
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 cgTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:11212/60‑1 (MQ=255)
  gTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:20993/59‑1 (MQ=255)
   tGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:25163/58‑1 (MQ=255)
       |                                                     
GCGTGGAGTATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATT  >  W3110S.gb/1040178‑1040238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑