Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,040,233 C→T C172C (TGC→TGT)  appB → cytochrome bd‑II oxidase, subunit II

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,040,2330CT100.0% 206.6 / NA 113C172C (TGC→TGT) appBcytochrome bd‑II oxidase, subunit II
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/113);  total (0/113)

Only 100 of 113 total aligned reads displayed.

GCGTGGAGTATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATT  >  W3110S.gb/1040178‑1040238
                                                       |     
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 cgTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:11212/60‑1 (MQ=255)
  gTGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:20993/59‑1 (MQ=255)
   tGGAATATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:25163/58‑1 (MQ=255)
                  gCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:74160/43‑1 (MQ=255)
                    ttCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGTGGAtt  <  1:35772/41‑1 (MQ=255)
                                                       |     
GCGTGGAGTATCTCGGCAGCTTCTGGCAACTGCTGACGCCATTCCCTTTATTGTGCGGATT  >  W3110S.gb/1040178‑1040238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑