Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,052,103 A→G intergenic (+8/‑166) cspG → / → ymcE DNA‑binding transcriptional regulator/cold shock gene

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,052,1030AG100.0% 200.7 / NA 106intergenic (+8/‑166)cspG/ymcEDNA‑binding transcriptional regulator/cold shock gene
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (106/0);  total (106/0)

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

ACGCTCTAAGGTTGCCATTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGTCATGGTT  >  W3110S.gb/1052087‑1052148
                |                                             
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aCGCTCTAAGGTTGCCGTTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGCCATGGt   >  1:34926/1‑61 (MQ=255)
                |                                             
ACGCTCTAAGGTTGCCATTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGTCATGGTT  >  W3110S.gb/1052087‑1052148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑