Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,059,579 T→C S358S (AGT→AGC torC → trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c‑type subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,059,5790TC100.0% 148.6 / NA 77S358S (AGT→AGCtorCtrimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c‑type subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (77/0);  total (77/0)

AACGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGTCTCGATAAACGTGAAGA  >  W3110S.gb/1059535‑1059596
                                            |                 
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:54998/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:71688/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:71040/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:68633/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:61390/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:59046/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:56528/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:56061/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:55874/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:55822/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:73312/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:54503/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:53102/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:51020/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:50994/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:50773/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:48624/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:46932/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:12098/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:77307/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:9821/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:8860/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:86089/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:84420/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:81718/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:80696/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:8064/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:78551/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:46905/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:76305/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:76188/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:76150/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:75611/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:75533/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:74034/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:73970/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:73417/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:18791/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:33209/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:46810/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:28729/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:28292/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:27409/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:25863/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:23813/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:19594/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:19569/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:32962/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:17874/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:17612/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:17518/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:16484/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:16282/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:16156/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:14249/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:13770/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:38650/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:46643/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:44589/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:43904/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:40828/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:39769/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:33332/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:38301/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:37783/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:37760/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:37338/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:34183/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:33797/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:33557/1‑62 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaag   >  1:80621/1‑61 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaag   >  1:33870/1‑61 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaag   >  1:41544/1‑61 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaag   >  1:44384/1‑61 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaag   >  1:31766/1‑61 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATCATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaag   >  1:80508/1‑61 (MQ=255)
aaCGGTTGGATCGGCACGCTCAACGCCATGATTGGCTTTACCAGCCTCGATAAACGTgaaga  >  1:49584/1‑62 (MQ=39)
                                            |                 
AACGGTTGGATCGGCACGCTCAACGGCATGATTGGCTTTACCAGTCTCGATAAACGTGAAGA  >  W3110S.gb/1059535‑1059596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: