Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	157,876	C→T	Q417Q (CAG→CAA)	pcnB ←	poly(A) polymerase I

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	157,876	0	C	T	100.0%	67.1 / NA	38	Q417Q (CAG→CAA)	pcnB	poly(A) polymerase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (38/0);  total (38/0)

TCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGC  >  W3110S.gb/157866‑157909           |                                  tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACtt          >  1:40662/1‑36 (MQ=255) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:6097/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:59865/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:63085/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:64529/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:64531/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:66523/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:6860/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:69143/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:71272/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:75654/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:77735/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:77741/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:80256/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:81268/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:83913/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:8427/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:84778/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:88201/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:41227/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:10783/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:11247/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:1189/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:13712/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:1579/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:30028/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:32006/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:40031/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:10269/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:42018/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:45898/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:47491/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:48905/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:52465/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:55614/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:55782/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCgt  >  1:58704/1‑43 (MQ=38) tCACCAGACGTTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCGGCTCg   >  1:81581/1‑43 (MQ=38)           |                                  TCACCAGACGCTGCAGTTCAGCGTTACGCTCAACTTCAGCTCGC  >  W3110S.gb/157866‑157909

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑